Το Λιμενικό Ταμείο Ζακύνθου, σύμφωνα με τις κείμενες διατάξεις, διαθέτει σχέδιο παραλαβής και διαχείρισης αποβλήτων πλοίων για τις κατηγορίες στερεά απορρίμματα, πετρελαιοειδή κατάλοιπα και έλαια, λύματα και επικίνδυνα στερεά.